А не может быть так, что когда контра сворачивается, мышь перемещается в левый верхний угол в контре... И так как игра запущена, она пытается перехватить управление мышью и поэтому она соответственно туда упрыгивает?
Я у себя наблюдал подобного вида глюк, но с программа другого типа. RAdmin, например, когда подключен к другому рабочему столу и выход из него не сделан. На машине, с которой управляют удаленным компом курсор стоит в одном месте. При попытке шавыряния мышью на машине, к которой подключен радмин пытаются работать мышью... Мышь несколько секунд ведет себя вроде адекватно (т.е. перемещается, отвечает на клики), но потом перепрыгивает на то место, на котором курсор установлен на удаленном управляющем компьютере...